吴庆军，男，山东汶上人。1999年7月毕业于中国协和医科大学，获博士学位。同年分配在北京协和医院内科学系，历任内科住院医师和总住院医师。2004年进入北京协和医院风湿免疫科任主治医师；2011年聘任副主任医师；2019年聘任主任医师。

主要从事风湿免疫性疾病的临床医疗、教学和临床研究工作。2006年至2008年在德国吕贝克医学院、Bad Bramstedt风湿病医院血管炎中心学习，主要从事Wegener肉芽肿病的发病机制的研究工作。内科临床工作近20年，着重风湿免疫病临床近15年。发表论文100余篇；参与编写《中华风湿病学》、《呼吸病学》、《图解风湿病学》、《风湿病诊断与诊断评析》、《风湿免疫科疑难病例分析》第1集、《风湿免疫科疑难病例分析》第2集》、《风湿免疫科疑难病例分析》第4集、《协和风湿免疫病答疑》、《常见风湿病及相关骨科疾病中西医结合诊治》等9部专业书籍的编写；共同主编≤风湿免疫科疑难病例分析≥第3集；参加《风湿病诊疗笔记》和《IgG4相关性疾病解读》编译。“类风湿关节炎的血清学诊断及其临床应用”作为主要参加者，荣获2005年中华医学科技三等奖。2012年度北京协和医院优秀员工称号。现为中国医师协会风湿病分会青年委员；中华医学会心身医学分会心身风湿协作学组委员；海峡两岸医药卫生交流协会风湿免疫病学专业委员会纤维肌痛综合征中西医研究学组常务委员；《中华临床免疫和变态反应杂志》编委。