眼科，院级重点专科，是“中医传统特色和现代医学亮点相统一”的发展科室。目前科室医师10名，主任医师1名，副主任医师1名，主治医师3人，其中硕士研究生2名，眼视光师1名。长期与浙江大学附属第一医院眼科、杭州市第一人民医院眼科及杭州市中医院眼科开展合作。本科室拥有蔡司手术显微镜、美国爱尔康白内障超声乳化仪、蔡司OCT、蔡司YAG激光机等，常规开展白内障超声乳化手术、翼状胬肉切除并自体角膜缘干细胞移植术、睑内翻矫正术、眼外伤等手术，并开展泪囊鼻腔吻合术、虹膜YAG激光术、玻璃体腔注药术等。在眼表疾病、白内障、青光眼、眼底疾病和儿童近视、弱视等问题有丰富的经验，并采用中西医结合治疗的方式，尤其在干眼症、角膜炎、葡萄膜炎和眼底出血等疾病有明显的优势。