中医科包含中医内科、中医妇产科、中医骨伤科、中医针灸推拿等专科。具有“冬病夏治、膏方调理、中药艾灸”等适宜技术，“耳穴压豆、穴位敷贴、中药灌肠、拔罐”等中医特色护理。中医科历史延展，培养出多位中医名家，如龚香圃（六一子）、叶伯敬、江钟灵、张玉恢等，为当地传统医学传承及发展做出重大贡献。2021年我院与浙大二院开展中医科山海协作，浙大二院专家长期坐诊我科，对我科进行技术及科研指导。中医科拥有中医师4名，主任医师1名，主治医师2名，住院医师1名，博士研究生1名，硕士研究生1名，衢州市名中医1名。

学科特色：现开展消化系统（包括胃肠功能紊乱、各种病毒性肝炎、肝硬化、酒精性及药物性肝病、脂肪肝等）、呼吸系统（包括咳嗽、哮喘、小儿肺炎喘嗽等）、风湿免疫、肾脏（水肿、尿浊、淋证等）、中医妇科（月经失调、产后调理、绝经期前后诸症、不孕不育、盆腔炎等）等中西医结合治疗。近年来大力推广我科“中药熏蒸、中药灌肠、冬病夏治、膏方调理、针灸推拿”等适宜技术及“耳穴压豆、穴位敷贴、拔罐”等中医特色护理。还有序开展中医药在产后中医药调理、女性盆腔炎灌肠以及女性气血膏方等特色诊治。