我院病理科创建于1994年，是浙二-UCLA病理联合诊断衢州分中心，与浙大附属第二医院病理科紧密合作，利用远程会诊平台实现国内甚至国外病理会诊，多次荣获年度浙江省临床病理室间质控评价“优胜单位”。占地面积约400余平米，作为衢江区病理诊断中心，承担全区临床组织病理、细胞病理学检查工作，每年病理检查工作量约18000余例。目前科室工作人员6人，其中副高职称2人，中级职称2人。科室配备有先进的设备，包括德国蔡司显微镜3台，德国蔡司三头显微镜1台、日本奥林巴斯显微镜1台、德国莱卡包埋机及石蜡切片机各1台、德国莱卡自动脱水机1台、德国莱卡全自动染色机1台、数字切片扫描仪1台等。

学科特设：开展全身活体组织病理学检查，细胞病理学检查(包括脱落细胞学，甲状腺针吸细胞学等细胞学检查),术中快速冰冻病理检查，免疫组化及特殊染色检查，分子病理学检查，病理远程会诊等诊疗技术。