呼吸与危重症医学科位于医院6号楼3楼，2012年独立成科(呼吸内科），2020年5月更名为呼吸与危重症医学科。现为垫江县临床重点专科，“重庆市呼吸专科医联体单位”、“重庆市呼吸专科联盟单位”。

科室现有开放病床80张（其中：呼吸重症监护室6张，普通病区74张），常年开设专家、专科、专病门诊，设有肺功能室、呼吸内镜室、睡眠呼吸疾病诊疗室、呼吸门诊综合诊疗室。配有德国耶格肺功能检测系统、澳大利亚康迪睡眠监测系统、日本OLYMPUS电子气管镜（290型、150型）及电子软式支气管镜、进口高端有创、无创呼吸机、库蓝冷冻治疗仪、床旁血气分析仪等先进设备。

科室业务：呼吸系统常见病、多发病、疑难重病的诊断治疗，对急慢性支气管炎、肺气肿、支气管哮喘、支气管扩张症、肺心病、肺部感染、肺间质纤维化、胸腔积液、肺癌、肺血管性疾病、呼吸衰竭、急性呼吸窘迫综合症、气胸等常见呼吸系统疾病和呼吸科疑难杂症的诊治，以及呼吸危重病人的抢救均具有丰富的临床经验。

特色技术：支气管镜检查及介入治疗术、经皮胸膜活检术、呼吸危重症患者有创、无创机械通气治疗、肺功能测定、支气管舒张试验、呼出气一氧化氮测定、睡眠呼吸监测、快速床旁血气分析等。