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重庆市医疗特色专科、垫江县医学重点学科，设消化内镜中心，消化专科门诊、住院部位于6号楼2楼。主要开展消化系统疾病诊疗及疑难病症诊疗、危急重症救治，如各种急慢性胃炎、胃及十二指肠球部溃疡、胃食管反流、溃疡性结肠炎、肠结核、肝硬化、酒精肝、脂肪肝、肝脓肿、急性胆囊炎、急性化脓性胆管炎、急慢性胰腺炎、消化道大出血、食管癌、原发性肝癌、胰腺癌等。

常年开展无痛内镜和胶囊内镜检查、食管胃底静脉曲张套扎术、食管静脉曲张硬化治疗术、食道球囊扩张及萨氏扩张、食管支架植入、消化道出血镜下止血、上消化道异物取出、胃肠息肉腺瘤摘除、消化道早癌粘膜切除术，以及14C呼气试验检测幽门螺杆菌、腹水浓缩回输术、ERCP胆总管取石术、鼻胆管引流术等技术项目。