中国中医科学院临床药理研究所是医院临床科研的重要技术支撑部门，其前身是卫生部于1983年首批通过的14个部属国家药物临床药理基地之一，是卫生部第一批临床药理培训中心，是我国最早进入GCP建设的中医单位。1995经国家中医药管理局和中国中医科学院批准正式成立中国中医科学院临床药理研究所，2012年成为国家中医药管理局中药临床药理重点学科建设单位，是国家“九五”、“十五”、“十一五”、“十二五”、“十三五”GCP平台建设单位。

2016年经国家发改委批复建设“中药临床疗效与安全性评价”国家工程实验室并于2021年纳入国家工程中心新序列管理。此外，2021年获批国家药监局重点实验室、北京市示范性研究型病房建设项目、北京市临床研究质量促进中心。

临床药理研究所秉承“提高中医药临床研究质量和水平”的宗旨，建立了重点病种的临床试验技术平台，形成以重大疾病为中心的全国临床试验协作网，I期研究室已实现基于TrialOne临床管理系统的无纸化操作模式。现承担了国家级重大课题21项，省部级课题13项；先后与国内外60余家制药企业签约，开展中药新药临床试验200余项，其中20余项中药新药获得新药证书。

近20年来，临床药理研究所培养了一批专业化、职业化的各类临床研究人员队伍。出版临床研究相关著作8部，发表SCI及国家核心期刊论文百余篇，取得国家教育部、中华中医药学会和北京市等各级科学技术奖项14项。取得软件著作权证书14项。形成国际标准1项，团体标准19项。
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