生物样本库

南通大学院附属医院(三级甲等)

推荐值:120

江苏省南通市崇川区西寺路20号

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 科室简介

建设历程
  2015年,医院领导班子审时度势、立足发展、着眼未来,从医院发展、学科建设和人才培养的角度,切合国内外医学发展趋势,高瞻远瞩地组建院级临床生物样本库。历时3年余,经医院各层面、多部门共同努力,整合医院宝贵资源,投入资金壹千万余元,购置一流进口设备,建成后用房面积约800平米,各类样本总存储量可达600万份的标准生物样本库。以此平台,引进培养海内外博士(后)人才,力争成为综合投入省内第一,国内名列前茅的院级生物样本库。
  院级生物样本库的建设和发展,是我院一项极力持续推进的重点项目。2019年5月30日,通大附院临床生物样本库正式启用,南通市首个综合性“生物银行”落成。此举对南通地区医学健康研究有着里程碑式的意义;对助推本地区及周边地区临床科研的发展,促进临床新技术、新项目的开展具有重要指导意义;提升江海百姓的健康水平具有深远意义。

学科特色
  临床生物样本是医学生命科学研究的基石,是转化医学研究的重要桥梁。样本存储作为医院的重要资源,是人才培养和学科建设的助推器,更是医院持续发展的动力源泉。
  生物样本库执行中国人类遗传资源管理条例,保护我院知识产权,成为功能统一、使用统一的样本标准化存用平台,设有超低温储存区、低温储存区、分析测试区、办公区等6大区域,以临床问题为导向,项目研究为依据,接收、预处理、存储临床生物样本(新鲜组织、石蜡组织、治疗前后的血液和体液),包括其临床资料与随访信息。
  生物样本库坚持引进与自主培养结合。现有具海外顶尖大学留学背景博士2名,全日制硕士3名。样本库成员获得各级人才称号,江苏省委“333”人才培养对象1名,江苏省医学重点人才1名,江苏省“六大人才高峰”培养对象1名,南通大学附属医院首批“英才计划”培养对象1名,南通大学附属医院“俊才计划”培养对象1名。

专科优势
  临床生物样本库,主要服务于临床各专科,以临床研究为主方向,夯实自然科学研究基础,大力推进转化医学研究,为我院综合实力提升和持续发展拓展前景。
  生物样本库引进国际水平新设备,开启新平台。先进的样本存储和软件管理系统,现有PerkinElmer自动化、高通量定量病理学成像系统Vectra 3、Autrax全自动核酸提取工作站、QuantStudio Dx Real-Time PCR系统、QX200 Droplet Digital PCR 系统、Agilent 2000 生物分析仪等样本加工检测的设备,确保各类样本合理、高效存用。
  生物样本库积极开展“活库”等新技术,举办各级学术讲座,接受临床样本相关的项目咨询、项目合作,协助医、护、药的员工和研究生开展临床样本相关的科研工作,促进样本的使用,为临床各专科样本,搭建院内外样本资源与科研团队的合作桥梁,也是临床研究与国际接轨,走向国内外一流水平的条件保证。
  自机构成立以来,样本库工作人员目前主持国自然面上项目2项,省科技厅社发重点前沿项目1项,国家发明专利获授权3件,实审5件。已在SCI收录期刊上发表学术论文10余篇,协助临床专科发表10余篇,共获得国自然项目资助3项,参编译生物样本学著作2部。
  展望时代与世界,通大附院上下齐心协力,在南通这方人杰地灵的水土之隅,面向长江三角洲一体化发展机遇,展翅飞翔。

手术及配套血液取样流程




仪器设备
  样本库管理系统(E-Biobank)
  生物样本库信息管理系统兼容各种生物样本保存容器,可记录样本采集、贮存、检索和出库过程中的相关信息,并对样本进行统一编号,采用条形码扫描管理出入库流程,同时配备多数据接口连接临床His、Lis等系统,支持多样本类型和多样本源之间的匹配。


  配套条码管理系统及冻存耗材
  样本库配备专业的条码打印及扫描系统,统一管理样本保护患者隐私;同时,耐低温标签及冻存盒、架可以满足临床各科室不同类型样本的存储需求



  专业化的低温存储设备
  ThermoTM液氮箱、ThermoTM-80℃低温冰箱以及SANYO-20~-40℃冰箱,能满足各类人体生物样本及样本冻存所需试剂的专业化存储需求。



  PerkinElmer Vectra自动化定量病理系统
  该设备可同时用于监视多达七个生物标记,且能够进行自动化,高通量,定量和定型的分析。



  QX200 Droplet Digital PCR 系统
  该设备由微滴生成仪和微滴分析仪构成,可用于痕量核酸检测、基因表达分析、拷贝数变异分析。



  BAKER RUSKINN 生理细胞培养工作站
  该设备可以在理想的生理氧气条件下研究复杂的细胞相互作用,满足精细氧气调节的细胞培养。




  QuantStudio Dx Real-Time PCR 系统
  该设备能满足实时荧光定量PCR的检测需求,且能提供最大化的通量、灵活性和扩展性。


  Autrax全自动核酸提取工作站
  该设备能够自动完成标本检测项目的识别,多种样本类型可一体化操作,实现标本中核酸的提取和加样工作。



  Agilent 2000生物分析仪
  该设备是样品质量控制的通用工具,可以评估多种样本获得的RNA、DNA 和蛋白质的完整性、浓度和纯度。




成果展示
16年至今生物样本库文章汇总

序号 题目 作者(#作者,*通讯) 杂志名称,年,期(卷),起始页码 影响 因子 中科院 大类分区
1 Triple-amiRNA VEGFRs inhibition in pancreatic
cancer improves the effificacy of chemotherapy
through EMT regulation 黄剑飞# J Control Release. 2017 Jan 10;245:1-14 7.901 医学一区
2 Effects of Rab27A and Rab27B on Invasion,
Proliferation, Apoptosis, and Chemoresistance
in Human Pancreatic Cancer Cells 黄剑飞* Pancreas. 2017 Oct;46(9):1173-1179 2.675 医学三区
3 High TREM2 expression correlates with
poor prognosis in gastric cancer 张筱静# Hum Pathol. 2018 Feb;72:91-99 2.740 医学三区
4 Identification specific miRNA in
t(4;14) multiple myeloma based on
miRNA-mRNA expressing profile
correlation analysis 王旭东* J Cell Biochem. 2018 Sep 19 3.448 生物三区
5 Hypoxia inducible factor 1α in
hepatocellular carcinoma with cirrhosis:
Association with prognosis 张筱静# Pathol Res Pract. 2018 Dec;214(12):1987-1992 1.794 医学四区
6 Hepatocellular carcinoma-derived
exosomal miRNA-21 contributes
to tumor progression by converting
hepatocyte stellate cells to
cancer-associated fibroblasts 黄剑飞* J Exp Clin Cancer Res. 2018 Dec 27;37(1):324 5.646 医学二区
7 KIAA1199 promotes invasion and
migration in non-small-cell lung
cancer (NSCLC) via PI3K-Akt
mediated EMT 黄剑飞* J Mol Med (Berl). 2019 Jan;97(1):127-140 4.746 医学二区
8 High Expression of RARβ Is a
Favorable Factor in Colorectal Cancer 王旭东* Dis Markers. 2019 Mar 3;2019:7138754 2.761 医学三区
9 High Expression of LTBP2 Contributes
to Poor Prognosis in Colorectal
Cancer Patients and Correlates with
the Mesenchymal Colorectal Cancer Subtype 王旭东* Dis Markers. 2019 Mar 10;2019:5231269 2.761 医学三区
10 ROS-mediated JNK pathway critically
contributes toPFOS-triggered
apoptosis in SH-SY5Y cells 孙萍萍# Neurotoxicol Teratol. 2019 Aug 8;75:106821 2.902 医学三区
11 Copy number variations primed
lncRNAs deregulation contribute
to poor prognosis in colorectal cancer 王旭东* Aging (Albany NY). 2019 Aug 22;11 5.515 生物二区
12 EphA8 acts as an oncogene and
contributes to poor prognosis in
gastric cancer via regulation of ADAM10 黄剑飞* J Cell Physiol.2019 Nov;234(11):20408-20419 4.522 生物二区
13 High RhCG expression predicts
poor survival and promotes migration
and proliferation of gastric cancer
via keeping intracellular alkaline 黄剑飞* Exp Cell Res. 2019 Nov 19:111740 3.329 医学二区
14 Increased expression of TTC21A
in lung adenocarcinoma infers
favorable prognosis and high
immune infiltrating level 黄剑飞* International Immunopharmacology
78 (2020) 106077 3.361 医学三区


2016年至今生物样本库课题资助汇总

序号 项目来源 项目名称及项目号 经费(万) 起止时间 项目负责人
1 国自然面上 外泌体传递circBIRC6调控GRIN2D影响自噬介导胃癌恶性表型的机制研究(81874067) 57*2 19.1.1-22.12.31 黄剑飞
2 国自然面上 GRP78-DYRK2相互作用对胃癌转移的影响及分子机制(81572390) 66*2 16.1.1-19.12.31 黄剑飞
3 江苏省科技厅前沿 基于二代测序及蛋白组学技术的胃癌精准医疗生物标记物的筛选鉴定及临床应(BE2018673) 100*2 18.7.1-21.6.30 黄剑飞
4 江苏省卫生计生委重点人才 抑癌基因USH1G相关的circRNA及其调控胃癌侵袭转移机制的研(ZDRCA2016051) 50*2 16.1.1-20.12.31 黄剑飞
5 江苏省卫生计生委“六个一工程” CircRNA经吸附miR-4472上调GRIN2D基因对胃癌发生发展的影响(LGY2016038) 5*2 17.1.20-19.1..20 黄剑飞
6 南通市重点病种规范化诊疗 建立多学科精准诊疗分子预测模型应用于胃癌临床规范化诊疗(MS32017001) 10 17.7.1-19.12.31 黄剑飞
7 南通市民生科技项目 人iPSCs在中枢神经系统损伤微环境中的修复作用机制研究(MS12018003) 10 18.6.1-20.6.31 陆冰
8 通大附院创新项目 基于生物信息学及高通量技术的肿瘤精准医疗生物标记物的筛选鉴定及临床研究 100 19.12.1-22.12.31 黄剑飞


2016年至今生物样本库奖项汇总

序号 时间 奖项类型 奖项名称 获奖人/排名 奖励等级 授予单位
1 2019年 江苏省卫健委医学新技术引进奖 消化系统肿瘤诊疗新靶点的临床应用研究 黄剑飞/1 二等奖 江苏省卫生健康委员会
2 2017年 江苏省医学科技奖 胰腺癌肿瘤细胞干细胞干性特征的基础与临床研究 黄剑飞/3 三等奖 江苏省医学会
3 2017年 南通市科学技术进步奖 抗VEGFR2人鼠嵌合型Fab抗体制备及在肝癌诊断和治疗中的意义 黄剑飞/1 二等奖 南通市人民政府
4 2016年 江苏省医学新技术引进奖 卵巢癌相关基因分析作为卵巢癌标志物及对其预后评价的应用 黄剑飞/3 一等奖 江苏省卫生和计划生育委员会
5 2016年 江苏省医学新技术引进奖 ROR2、RAB27、RAB27B和CXCR2基因在胰腺导管癌临床诊断和治疗中的应用 黄剑飞/3 二等奖 江苏省卫生和计划生育委员会


2016年至今生物样本库学会任职人员汇总

序号 学会任职 人员 学会/协会名称
1 江苏省医学会流行病学分会第三届副主任委员 黄剑飞 江苏省医学会
2 中国研究型医院学会第一届临床数据与样本资源库专业委员会委员 黄剑飞 中国研究型医院学会
3 中国抗癌协会第一届肿瘤样本整合研究分会委员 黄剑飞 中国抗癌协会
4 中国医药生物技术协会组织生物样本库分会委员 黄剑飞 中国医药生物技术协会
5 中国医药生物技术协会精准医疗分会委员 黄剑飞 中国医药生物技术协会
6 南通市医学学会病理学分会第七届委员会委员 黄剑飞 南通市医学会


2016年至今生物样本库专利汇总

序号 发明类型 专利名称 授予国别 专利号
1 发明专利 一种靶向FoxQ1基因的干扰siRNA及其抗非小细胞肺癌的用途 中国 ZL 2013 1 0553005.2
2 发明专利 131I标记抗VEGFR2嵌合Fab及其应用 中国 ZL 2013 1 0194589.9
3 发明专利 一种MAGE-A9的用途 中国 ZL 2015 1 0556744.6