医院建院之初病案由药房保管，资料显示1958年有病案室的记录，归医务科管理。2001年成立统计信息科，病案室并入统计信息科，2007年成立病案管理科，为正科级建制。
病案库房面积约900平方米，密集架100余组，保存管理自建院至今近96余万册病案。科室现有员工11人，其中：高级职称1人，中级2人，初级5人（病案信息技术系列职称5人），档案管理员3人；取得国际疾病分类与手术操作水平考试资格证4人。
工作职责：负责全院出院病案的收集、整理、加工、处理、存储、检索和运输并保存病案；在医院信息系统的支撑下，病案管理工作逐步向网络化、信息化推进，提高了服务临床和患者的能力；接待出院患者及有关人员复印病案，为病人的医疗、为科研与教学提供信息服务，同时高度重视患者信息安全；按照医院三级评审的要求进行病案首页质控，每月完成三级公立医院绩效考核首页规范数据填写及上报工作；强化DRG质控，每日审核并上传医保结算清单以配合医保DRG支付工作；同时在全院内进行针对临床医师的基于DRGs首页填写培训及ICD-10诊断编码ICD-9-CM-3手术编码基础知识普及工作。
现任科室负责人担任中国医院协会病案管理专业委员会第七届常务委员，青海省病案管理专业委员会副主任委员，青海省病案质控中心副主任，青海省档案系列职称高评委。
多年来，病案管理科为医院改革发展做出了应有的贡献。新时代，新征程，病案管理科在院党委的领导下，树立新发展理念，构建新发展格局，坚持标准化、规范化、科学化管理，秉承以患者为中心、红十字让生命更健康的服务宗旨，病案管理人员将不断学习深化专业技术，积极引进先进理念和先进技术，以提高病案管理水平，围绕本院临床、科研、管理需要提供优质服务。不断探索和实践，加快电子化建设步伐，深层次挖掘病案、统计信息资源的潜在价值，为医院领导决策提供数据支持，为病案信息的现代化管理做出应有贡献。