小儿心脏、肾病、风湿免疫科是集医、教、研为一体的甘肃省小儿心脏肾病风湿免疫诊治中心。科室由病房、门诊、心导管室及心电图室等组成。病房核定床位41张，现有硕士研究生导师1名，硕士研究生3名，主任医师1名，主治医师3名。 心脏专业开展的业务有：先天性心脏病及外周介入治疗、心律失常的射频消融治疗、儿童心脏起博器的植入及川崎病、心肌炎和心肌病的诊治。肾病专业开展的业务有：儿童各类肾小球疾病、肾小管疾病及急慢性肾脏衰竭的内科治疗。风湿免疫性疾病开展的业务有：儿童及青少年系统性红斑狼疮（SLE）、幼年特发性关节炎（JIA）、系统性血管炎、皮肌炎、巨噬细胞活化综合征、原发干燥综合征、炎症性肠病相关关节炎、结缔组织疾病相关葡萄膜炎、白塞氏病、重叠综合征、脂膜炎、结节病、系统性硬化等。