创建于2011年12月。目前设有呼吸科普通门诊、呼吸科特色门诊（康复门诊、咳嗽门诊、变应反应门诊、睡眠障碍门诊、戒烟门诊）、呼吸科病房、重症康复病房、睡眠监测室、肺康复室、肺功能室、气管镜室等，服务全岛军地患者。在呼吸康复诊治、慢性阻塞性肺疾病、下呼吸道感染、肺癌的综合诊治和个体化治疗、间质性肺部疾病、胸部介入治疗、睡眠呼吸障碍等方面具有丰富经验。在岛内内率先开展了肺康复技术、内科胸腔镜、支气管下肺减容术、EBUS、支气管肺冷冻术、APC等治疗。