消化内镜中心是浙江省乃至全国专业学科最早建立且规模最大的内镜中心之一，是中华医学会及中国医师协会内镜专业技术培训基地，是卫生部内镜专业技术消化科培训基地，拥有消化内镜唯一的浙江省创新学科-“消化内镜诊治学”。目前拥有36个诊室（36台主机），200余条内镜（151条胃肠镜，40条超声小探头，5根超声环扫镜，8根超声穿刺镜，2根双气囊小肠镜），45台洗消机，不同型号胶囊内镜（包括磁控胶囊内镜）。